A nukleozidok és nukleotidok

A szabad bázis lényegesen kevésbé bőségesen előfordul a természetben, mint a megfelelő nukleozidok és nukleotidok. Molekulák nukleozidok (. Ábra 34,8) vannak kialakítva egy purin vagy pirimidin bázis, amely (-bond kapcsolódó szénhidrát (általában -riboza vagy -dezoksiriboza) N, vagy rendre-helyzetben tehát, adenin ribonukleozid (adenosis), és magában foglalja a adenin. - ribóz-helyzetben kapcsolódó, guanoziniz -ribozy guanin és citozin pozícióban tsitidiniz és ribóz pozícióban uridiniz uracil és ribóz pozícióban N, és a kapcsolat -dezoksiribozy ribóz, vagy bázis, hogy a gyűrű alakú szerkezet miatt előfordul, hogy a viszonylag savas GR Labi noy -glikozidnoy kapcsolatot. Elméletileg maradékot cukor és egy purin (vagy pirimidin), a bázis szabadon forog a tengelye körül a glikozidos kötés, de a valóságban vannak sztérikus gátlást e. Húsossági anti lényegesen előnyösebb, mint a természetes nukleozidok (ábra. 34,9). A részletes magyarázat erre a jelenségre meg fogja találni a Sec. 37. itt fogjuk mondani, hogy csak a forma az anti előfeltétele komplementációjára purin és pirimidin bázisok a kettős szálú molekula dezoksiribonu A kleinovoy sav formában. (Mivel a D-ribóz ábrázolt hagyományos formában a legtöbb számok és a másik fej, purin és pirimidin nukleozidok és nukleotidok mutatja -conformation kevésbé előnyös.)

A szerkezet a 2-dezoxiribonukleozidok vannak purin vagy pirimidin bázis és -dezoksiriboza kapcsolódhatnak az ugyanazon atomok

Ábra. 34.7. A szerkezet a tautomerek, a citozin, timin. adenin és a guanin, jelezve az uralkodó formák.

Ábra. 34.8. A szerkezet a RNS-nukleozidot.

Ábra. 34.9. A szerkezet a szin- és antikonfiguratsy adenozin.

Ábra. 34.10. Structure adenilsav-(AMP) (balra) és 2-dezoksiadenilovoy sav (DAMP) (jobb).

Ábra. 34.11. Szerkezete uridilsav (UMP) (balra) és timidilsavvá savat (TMP) (jobb).

Nukleotidok - egy nukleozid-származékok által foszforilált egy vagy több hidroxilcsoporttal, a ribóz (vagy dezoxiribóz) (ábra 34.10.). Így az adenozin-monofoszfát (AMP vagy adenilát) épített az adenin, ribóz és a foszfát. 2-Dezoksiadenozinmonofosfat (nedves vagy dezoksiadenilat) álló molekula adenin, 2-dezoxiribóz és a foszfát. Jellemzően uracil van rögzítve a ribóz a timin-2-dezoxiribóz. Ezért, timidilsavvá sav (TSR) áll timin, 2'-dezoxiribóz és a foszfát. és egy részét uridilsav (UMP) tartalmazza az uracil és a ribóz-foszfát (ábra. 34.11). DNS egy polimer timidilsavvá, dezoksitsitidilovoy-2, 2-dezoksiadenilovoy és 2-deoxyguanylic sav. RNS képződik a kopolimerizációs uridilsav, citidilsav, guanilsav és adenilsav.

Amellett, hogy ezek a formák a nukleotidok és nukleotid talált szokatlan szerkezetet. Így a tRNS azonosított nukleotid, ahol a ribóz csatlakozik a uracil az ötödik helyzetben, azaz. E. Nem nitrogén-szén kötés, és szén-szén. ez a szokatlan addíciós terméket nevezett pszeudouridin (y). TRNS-molekulák egy olyan nukleotidszekvenciát és egy másik szokatlan szerkezetet - timin kapcsolt ribozomonofosfatom. Ez a nukleotid képződik szintézis után tRNS metilezésével maradékot UMP S-adenozil-metionin (cm. Alább). Psevdouridilovaya savat is képződik eredményeként az átrendeződés után UMP szintézis tRNS.

Nómenklatúra A nukleozidok és nukleotidok

A helyzet a foszfát-csoportok a nukleotid molekula jelzi számjegyet. Például, az adenozin egy foszfát-csoport kapcsolódik a szén-dioxid-ribóz kell kijelölni monofoszfát. Vonalkód következő számokat adja meg, hogy megkülönböztessék a szén-dioxid-számot a purin- vagy pirimidin-bázis a helyzetét az atom a maradékot (dezoxi) ribóz. Amikor számozás a szénatomok a bázis bár nem hozott. NUKLEOTID -dezoksiadenozin foszfát rész a szén-5 cukormolekula nevezzük 2-dezoxiadenozin-5-monofoszfát (ábra. 34.12).

Nucleosides tartalmazó adenin, guanin, citozin, timin és uracil, általában jelöli az A, G, C, T, illetve az U. Miután előre kivágott levél d jelzi, hogy a szénhidrát-összetevő a nukleozid egy 2 -dezoxiribóz. Guanozin tartalmazó -dezoksiribozu jelölhető dG (dezoxi-guanozin), és a megfelelő monofoszfát, egy foszfát-csoport kapcsolódik a harmadik szénatomon dezoxiribóz, -DG-3-MP. Jellemzően, azokban az esetekben, ahol a foszfát kapcsoljuk az 5-helyzetű szénatomjának a ribóz vagy a dezoxiribóz, szimbólum 5 elhagyjuk. Így az 5-monofoszfát guanozin általában jelöljük GMP, 5-monofoszfát 2'-dezoxi-guanozin rövidítve DGMP. Ha egy szénhidrát csatolt aminosav nukleozid 2 vagy 3 maradékok foszforsav.

Ábra. 34.12. Structure 3 adenozin-monofoszfát (balra) és 2-dezoxiadenozin-5-monofoszfát (jobbra).

Ábra. 34.13. A szerkezet a ATP-t és a megfelelő di- és monofoszfát formáinak.

Használt rövidítések DP (difoszfát) és TP (trifoszfát). Így az adenozin-trifoszfát + három foszfát-csoportokat az 5-helyzetben a szénhidrát-vel fogjuk jelölni ATP. ATP szerkezete, valamint a megfelelő di- és monofoszfátok ábrán mutatjuk be. 34.13. Mivel a molekulák nukleotid foszfátok a foszforsav anhidridek, t. E. Abban az állapotban, alacsony entrópia, ezek az úgynevezett macroergs (amelynek nagy tartalék potenciális energia). Hidrolízise 1 mol ATP ADP felszabadul a potenciális energia.